В соответствии с приказом председателя КГБ при Совете Министров СССР № 0287 от 27 сентября 1965 г. к 1 июня 1966 г. в г. Багратионовске Калининградской области на базе военного городка 95 пограничного отряда и первого корпуса Высшего пограничного командного училища было сформировано Военно-техническое училище КГБ при Совете Министров СССР для подготовки офицеров связи органов и войск КГБ. Срок обучения курсантов ВТУ был установлен 3 года, а для слушателей курсов переподготовки - 3-5 месяцев. Из Московского пограничного училища были переданы все курсанты, оканчивающие в 1966 г. 1 и 2 курсы обучения. Начальником училища назначен С.Г. Орехов. 31 августа 1966 г. на основании Указа Президиума Верховного Совета СССР заместитель председателя КГБ генерал-майор Л.И. Панкратов от имени     

Президиума Верховного Совета СССР вручил ВТУ Боевое Красное Знамя и Грамоту Президиума Верховного Совета СССР. Этот день ежегодно отмечается как день образования училища. С 1 сентября 1966 г. начался учебный процесс. Организационно ВТУ представляло:

управление училища;

циклы и отдельные дисциплины (основы будущих кафедр);

основные подразделения (курсантские дивизионы по курсам);

дивизион переподготовки офицерского состава;

подразделения учебного обеспечения и обслуживания.

В каждом курсантском дивизионе предусматривалось обучение по профилям. Более 60 % выпускников готовилось непосредственно для войск правительственной связи, остальные - для органов и войск КГБ и МВД. Бурное развитие средств связи и техническое переоснащение войск диктовали настоятельную необходимость более высокой инженерной подготовки офицеров-связистов. В соответствии с приказом председателя КГБ при Совете Министров СССР № 0212 от 14 июня 1971 г. Военно-техническое училище 1 октября 1972 г. преобразуется в высшее военное командное училище связи (с дислокацией в г. Орле) по подготовке офицеров командного состава с высшим образованием. В июле 1972 г. в г. Орле произведен первый набор курсантов для 4-годичного обучения. На базе циклов и отдельных дисциплин создаются кафедры. Осуществляется переход на батальонную систему обучения курсантов. Начинается большое строительство учебно-административного комплекса, лекционных залов, курсантских казарм и других объектов. В августе 1973 г. начальником ОВВКУС назначается В.А.Мартынов. К 1975 г. по среднему профилю выпущено 2303 офицера, из которых непосредственно в войска правительственной связи направлено 1454 (то есть 63,2 %). В июле 1976 г. был произведен первый выпуск офицеров с присвоением инженерной квалификации и вручением дипломов о высшем образовании общесоюзного образца. Приказом председателя КГБ при СМ СССР № 97 от 12 июля 1976 г. объявлено постановление СМ СССР от 17 июня 1976 г. № 471 о присвоении Орловскому высшему военному командному училищу связи КГБ при СМ СССР имени М.И.Калинина за высокие показатели, достигнутые при подготовке офицерских кадров.

В 1993 г. произведен последний выпуск офицеров по 4-годичной программе. С 1976 г. по 1993 г. училищем подготовлено около 4000 специалистов, из которых более 60% было направлено в органы и войска правительственной связи. В 1991 г. в государственных структурах России было образовано Федеральное Агентство правительственной связи и информации при Президенте Российской Федерации (ФАПСИ). Президентом России перед ФАПСИ были поставлены задачи, выполнение которых потребовало разработки принципиально нового концептуального подхода к подготовке сотрудников Федерального Агентства. Поэтому, в соответствии с Указом Президента Российской Федерации от 21 марта 1992 г. приказом генерального директора ФАПСИ 23 апреля 1992 г. ОВВКУС им. М.И. Калинина преобразовано в Военный институт правительственной связи. Начальником института назначен генерал-майор В.А. Мартынов. 01.10. 1992 г. осуществлен переход на факультетскую систему обучения курсантов. В 1993 г. при ВИПС образована аспирантура и проведен первый набор для очного и заочного обучения.

6 марта 1994 г. ВИПС первым из военных вузов России получил лицензию на право ведения образовательной деятельности по установленным специальностям. С 1995 г. начался выпуск офицеров, прошедших обучение по 5-летней программе. В 1996 г. утверждена новая организационно-штатная структура института. Имеется и совершенствуется учебно-методический и научно-информационный комплекс в составе кафедр, научно-исследовательского отдела, аспирантуры, отдела информационно-телекоммуникационных систем с дисплейными классами, методических кабинетов, бюро научно-технической информации, библиотеки с читальными залами. 23.02.1993 г. на базе ВИПС открыт для посещения Музей правительственной связи, который 22. 10. 1993 г. занесен в реестр государственных музеев России, а 29.10.1996 г. реорганизован в Музей ФАПСИ при Президенте России 

Распоряжением Президента Российской Федерации от 30 марта 2000 г. № 94-рп постановлением Правительства Российской Федерации от 12 апреля 2000 г. № 336 в целях совершенствования подготовки, переподготовки и повышения квалификации военных кадров в области правительственной связи и иных видов специальной связи, радиоэлектронной разведки средств связи и защиты информации, активизации фундаментальных и прикладных научных исследований и в соответствии с Федеральным законом "Об обороне" Военный институт правительственной связи преобразован в Академию Федерального агентства правительственной связи и информации при Президенте Российской Федерации.

Сегодня Академия ФСО является государственным военным образовательным учреждением высшего профессионального образования, ведет подготовку офицеров по следующим специальностям:

сети связи и системы коммутации;

многоканальные телекоммуникационные системы;

радиосвязь, радиовещание и телевидение;

информационная безопасность телекоммуникационных систем;

автоматизированные системы обработки информации и управления.

По окончании Академии присваивается воинское звание "лейтенант", выдаются нагрудный знак и диплом о высшем профессиональном образовании с присвоением квалификации инженера по одной из вышеперечисленных специальностей. Срок обучения - 5 лет.

Период обучения в Академии ФСО защитывается в срок действительной военной службы.

Тысячи выпускников ВТУ-ОВВКУС-ВИПС-Академии ФАПСИ - Академии ФСО с честью выполняют свой долг. Полученные знания и навыки позволили многим из них достичь больших успехов в службе и занять руководящие должности в структурных подразделениях ФАПСИ, ФСБ, МВД, ФПС. Среди них командиры частей, соединений и даже командующие войсками. Начальник Управления войск правительственной связи генерал-лейтенант О.В.Иванов закончил ВТУ в 1971 г., а начальник 1 Главного управления ФАПСИ генерал-лейтенант А.Н.Пономарев - ОВВКУС в 1978 г. 3 заместителя начальника Академии ФАПСИ, начальник учебного отдела, 7 начальников кафедр, большинство научных сотрудников, преподавателей, командиров - наши выпускники. Славное прошлое и настоящее нашего учебного заведения, его традиции, постоянно совершенствующаяся материально-техническая и научно-информационная база, методическое мастерство и профессионализм профессорско-преподавательского и командного состава - все это залог успешного решения задач, которые сегодня стоят перед Академией ФСО России.